MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Herminiimonas arsenicoxydans chromosome

Total Repeats: 8388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009138	ACA	2	6	22	27	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009138	TGCC	2	8	113	120	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009138	TGA	2	6	132	137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009138	GCCTG	2	10	145	154	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_009138	TAAG	2	8	1738	1745	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009138	TGA	2	6	1863	1868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009138	GCA	2	6	1902	1907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009138	TAA	2	6	1924	1929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009138	AAT	2	6	1961	1966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009138	AGT	2	6	3133	3138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009138	AAAGTA	2	12	3190	3201	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009138	T	6	6	3438	3443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009138	AGTT	2	8	5970	5977	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009138	A	6	6	5991	5996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009138	TTCA	2	8	7177	7184	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009138	A	7	7	7991	7997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009138	T	6	6	8005	8010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009138	AT	3	6	8026	8031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009138	T	6	6	8031	8036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009138	GAT	2	6	8053	8058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009138	ATT	2	6	8078	8083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009138	T	7	7	8082	8088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009138	AG	3	6	8105	8110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009138	TAA	2	6	8144	8149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009138	TTCGC	2	10	8172	8181	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_009138	ATC	2	6	10006	10011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009138	TAG	2	6	10043	10048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009138	GATGG	2	10	10674	10683	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009138	GGC	2	6	10733	10738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009138	GCA	2	6	10743	10748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009138	CATC	2	8	10778	10785	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009138	TTC	2	6	11983	11988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009138	GGA	2	6	12080	12085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009138	CATT	2	8	12121	12128	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009138	CCT	2	6	12689	12694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_009138	GAA	2	6	12696	12701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009138	CGT	2	6	12723	12728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009138	CTG	2	6	12737	12742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009138	CATT	2	8	14747	14754	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009138	CAT	2	6	14804	14809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009138	TTG	2	6	14860	14865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009138	TGAG	2	8	14907	14914	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009138	A	6	6	15010	15015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009138	T	7	7	15060	15066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009138	TCA	2	6	17254	17259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009138	A	6	6	17302	17307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009138	T	6	6	17331	17336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009138	GCG	2	6	17341	17346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009138	TCG	2	6	17891	17896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009138	CAA	2	6	17917	17922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009138	GAT	2	6	18000	18005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009138	GCG	2	6	18022	18027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009138	A	8	8	18102	18109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009138	CTAT	2	8	18132	18139	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009138	A	6	6	20158	20163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009138	AAT	2	6	20191	20196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009138	GC	3	6	23314	23319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009138	ATC	2	6	24331	24336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009138	TGA	2	6	24339	24344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009138	A	7	7	24350	24356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009138	T	6	6	24373	24378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009138	CTTT	2	8	26002	26009	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009138	TAAA	2	8	26018	26025	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009138	TGC	2	6	26066	26071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009138	ACT	2	6	26137	26142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009138	GCTC	2	8	26765	26772	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009138	ATT	2	6	26773	26778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009138	TTC	2	6	26796	26801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009138	CTT	2	6	26840	26845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009138	TAT	2	6	26861	26866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009138	TGC	2	6	26883	26888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009138	CGC	2	6	27917	27922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_009138	CGGC	2	8	27927	27934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009138	CAC	2	6	27960	27965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_009138	TCC	2	6	27994	27999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_009138	TTTC	2	8	28028	28035	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009138	TTCAA	2	10	28040	28049	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_009138	CGG	2	6	28820	28825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009138	CAA	2	6	28839	28844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009138	GGAA	2	8	28871	28878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009138	GC	3	6	29135	29140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009138	CGCA	2	8	29572	29579	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009138	TCGACA	2	12	29662	29673	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009138	GCAG	2	8	30291	30298	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_009138	GCT	2	6	30734	30739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009138	ACCTG	2	10	30937	30946	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_009138	CG	3	6	31006	31011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009138	CATT	2	8	31012	31019	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009138	TGC	3	9	33366	33374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009138	GTC	2	6	33390	33395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009138	CGC	2	6	33631	33636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_009138	TTAA	2	8	33698	33705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009138	CGC	2	6	35945	35950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_009138	CAA	2	6	35977	35982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009138	CTTC	2	8	37168	37175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009138	AGC	2	6	40280	40285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009138	CAAG	2	8	41031	41038	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009138	TTG	2	6	42488	42493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009138	TTG	2	6	43126	43131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009138	TCT	2	6	43208	43213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009138	TGTT	2	8	43308	43315	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009138	GCCA	2	8	44377	44384	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009138	GC	3	6	44401	44406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009138	TTG	2	6	46704	46709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009138	GTGCA	2	10	46724	46733	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_009138	A	6	6	46763	46768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009138	GGGA	2	8	46807	46814	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009138	TGC	2	6	46818	46823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009138	GCA	2	6	46831	46836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009138	TGA	2	6	46840	46845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009138	TGC	2	6	46849	46854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009138	GTGC	2	8	48692	48699	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_009138	CTC	2	6	50900	50905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_009138	GGAA	2	8	52395	52402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009138	TGGC	2	8	52898	52905	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_009138	T	7	7	53019	53025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009138	AATG	2	8	53049	53056	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009138	ACT	2	6	53105	53110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009138	AATTT	2	10	53138	53147	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009138	CG	3	6	53159	53164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009138	A	6	6	53171	53176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009138	CGG	2	6	53193	53198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009138	CGC	2	6	54081	54086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_009138	TTGA	2	8	54091	54098	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009138	CAT	2	6	54159	54164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009138	ATT	2	6	54204	54209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009138	CGG	2	6	54235	54240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009138	CAT	2	6	54263	54268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009138	CA	3	6	54295	54300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009138	TCAA	2	8	54315	54322	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_009138	GCCT	2	8	54339	54346	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_009138	AGCG	2	8	58073	58080	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_009138	AAGTG	2	10	58593	58602	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009138	TGC	2	6	59169	59174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_009138	TCCA	2	8	59192	59199	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009138	GCA	2	6	59222	59227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_009138	GGC	2	6	59287	59292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009138	GC	3	6	59416	59421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_009138	GGC	2	6	59436	59441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009138	AGG	2	6	60205	60210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009138	CCA	2	6	60663	60668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_009138	T	6	6	61252	61257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009138	GCT	2	6	61858	61863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_009138	GTT	2	6	61876	61881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009138	TCAG	2	8	61896	61903	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_009138	T	6	6	61938	61943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009138	CG	3	6	62315	62320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_009138	A	8	8	62327	62334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009138	GCA	2	6	62354	62359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_009138	T	6	6	62367	62372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009138	GGC	2	6	62388	62393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_009138	ATT	2	6	62735	62740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_009138	AGC	2	6	65693	65698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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168	NC_009138	AAG	2	6	66735	66740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_009138	AGG	2	6	66761	66766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_009138	TTGC	2	8	66948	66955	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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181	NC_009138	TTG	2	6	70661	70666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_009138	GCG	2	6	74807	74812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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276	NC_009138	A	6	6	110389	110394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_009138	T	6	6	110452	110457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_009138	A	7	7	110557	110563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_009138	GAA	2	6	110583	110588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_009138	TGG	2	6	110951	110956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
282	NC_009138	CAGC	2	8	110973	110980	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
283	NC_009138	TCT	3	9	110998	111006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_009138	CAG	2	6	111017	111022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_009138	T	7	7	111027	111033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_009138	GT	3	6	111148	111153	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
287	NC_009138	ATG	2	6	111267	111272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
288	NC_009138	GGAA	2	8	111284	111291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
289	NC_009138	TGT	2	6	111296	111301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_009138	ATG	2	6	111337	111342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_009138	GCA	2	6	112507	112512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_009138	ATG	2	6	112551	112556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_009138	TTG	2	6	113848	113853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_009138	CAT	2	6	114426	114431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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332	NC_009138	TTG	2	6	134681	134686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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419	NC_009138	CTT	2	6	171833	171838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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421	NC_009138	AAT	2	6	173143	173148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_009138	CG	3	6	173192	173197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
423	NC_009138	CG	3	6	173207	173212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
424	NC_009138	T	6	6	173215	173220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_009138	A	6	6	186188	186193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_009138	CAT	2	6	186431	186436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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449	NC_009138	GGC	2	6	189657	189662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
450	NC_009138	AGT	2	6	189681	189686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_009138	GA	3	6	198132	198137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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